-
Path: news-archive.icm.edu.pl!news.icm.edu.pl!newsfeed2.atman.pl!newsfeed.atman.pl!.P
OSTED!not-for-mail
From: Borneq <b...@a...hidden.pl>
Newsgroups: pl.comp.programming
Subject: Re: Ktoś używał 1000genomes? Diff
Date: Mon, 5 Feb 2018 13:53:07 +0100
Organization: ATMAN - ATM S.A.
Lines: 21
Message-ID: <p59k3h$ofh$1@node1.news.atman.pl>
References: <p587gc$652$1@node2.news.atman.pl> <p588eh$71r$1@node2.news.atman.pl>
<e...@g...com>
NNTP-Posting-Host: public-gprs351732.centertel.pl
Mime-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=utf-8; format=flowed
Content-Transfer-Encoding: 8bit
X-Trace: node1.news.atman.pl 1517835185 25073 37.47.5.53 (5 Feb 2018 12:53:05 GMT)
X-Complaints-To: u...@a...pl
NNTP-Posting-Date: Mon, 5 Feb 2018 12:53:05 +0000 (UTC)
User-Agent: Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; WOW64; rv:52.0) Gecko/20100101
Thunderbird/52.6.0
In-Reply-To: <e...@g...com>
Content-Language: pl
Xref: news-archive.icm.edu.pl pl.comp.programming:212267
[ ukryj nagłówki ]W dniu 05.02.2018 o 10:31, M.M. pisze:
> Dziedzina wiedzy dziedziną wiedzy, ale porównania się robi i używa się
> do tego analogicznych algorytmów jak do porównywania ciągów znaków.
Czytałem o algorytmie Myersa wspaniale wytłumaczonym na blogu jcoglan.
Znajduje maksymalny wspólny podciąg, ale rozwiązań może być wiele. W
podstawowej wersji ma tę miłą właściwość że gromadzi inserty i delety
razem. Jednak wersja profesjonalna, używająca liniowego a nie
kwadratowego miejsca pamięci, nie ma tej właściwości.
Przykład:
https://blog.jcoglan.com/2017/03/22/myers-diff-in-li
near-space-theory/
Jak można by to poprawić? Może najpierw rekurencyjnie dzielić na bloki,
ale gdy blok nie przekracza 50 wierszy, robić wersję standardową?
Poza tym, implementacja Butlera z CodeProject dla liniowego:
782104906830590
683059078210490
daje lepsze rezultaty niż można by się spodziewać.
Git ma jeszcze możliwość opcji --patience, która poprawia, jednak
wyszukując unikalne wiersze - nie nadaje się np. do genomu.
Następne wpisy z tego wątku
- 05.02.18 18:13 M.M.
- 05.02.18 22:19 Borneq
- 06.02.18 10:55 M.M.
- 09.02.18 11:09 Borneq
- 09.02.18 12:42 Borneq
Najnowsze wątki z tej grupy
- AEiC 2024 - Ada-Europe conference - Deadlines Approaching
- Jakie są dobre zasady programowania programów opartych na wtyczkach?
- sprawdzanie słów kluczowych dot. zła
- Re: W czym sie teraz pisze programy??
- Re: (PDF) Surgical Pathology of Non-neoplastic Gastrointestinal Diseases by Lizhi Zhang
- CfC 28th Ada-Europe Int. Conf. Reliable Software Technologies
- Młodzi programiści i tajna policja
- Ada 2022 Language Reference Manual to be Published by Springer
- Press Release - AEiC 2023, Ada-Europe Reliable Softw. Technol.
- Ada-Europe - AEiC 2023 early registration deadline approaching
- Ada-Europe Int.Conf. Reliable Software Technologies, AEiC 2023
- Ile cykli zajmuje mnożenie liczb 64-bitowych?
- Ideologia Polskiego Programisty wer.3
- Ada-Europe Conference - 6 March Extended Final Deadline
- Szybkie pytanko do fachowców od Bourne shella
Najnowsze wątki
- 2024-03-28 Eltec nie zyje?
- 2024-03-28 Katowice => Application Engineer for Service and Deployments <=
- 2024-03-28 Wrocław => Mid PHP Developer (Laravel) <=
- 2024-03-28 Vectra 'Plan domowy bez limitu'
- 2024-03-28 Szczecin => Starszy inżynier oprogramowania (Rust) <=
- 2024-03-28 Zielona Góra => Spedytor międzynarodowy <=
- 2024-03-28 Wnuczek z Wehrmachtu idzie na rympal.
- 2024-03-28 Bażanowice => Inżynier Industrializacji - Elektronik <=
- 2024-03-28 Warszawa => Senior Account Manager <=
- 2024-03-28 Czy kompozyty (poliamid) są lepsze od stopów metali?
- 2024-03-28 nowa Skoda z potężnym silnikiem
- 2024-03-27 o Pegasusie raz jeszcze
- 2024-03-27 Gdańsk => Transport Operations Coordinator Deep Sea with Spanish or P
- 2024-03-27 Kraków => Frontend Software Engineer <=
- 2024-03-27 Białystok => Senior Rust Software Engineer <=