-
Data: 2018-02-05 13:53:07
Temat: Re: Ktoś używał 1000genomes? Diff
Od: Borneq <b...@a...hidden.pl> szukaj wiadomości tego autora
[ pokaż wszystkie nagłówki ]W dniu 05.02.2018 o 10:31, M.M. pisze:
> Dziedzina wiedzy dziedziną wiedzy, ale porównania się robi i używa się
> do tego analogicznych algorytmów jak do porównywania ciągów znaków.
Czytałem o algorytmie Myersa wspaniale wytłumaczonym na blogu jcoglan.
Znajduje maksymalny wspólny podciąg, ale rozwiązań może być wiele. W
podstawowej wersji ma tę miłą właściwość że gromadzi inserty i delety
razem. Jednak wersja profesjonalna, używająca liniowego a nie
kwadratowego miejsca pamięci, nie ma tej właściwości.
Przykład:
https://blog.jcoglan.com/2017/03/22/myers-diff-in-li
near-space-theory/
Jak można by to poprawić? Może najpierw rekurencyjnie dzielić na bloki,
ale gdy blok nie przekracza 50 wierszy, robić wersję standardową?
Poza tym, implementacja Butlera z CodeProject dla liniowego:
782104906830590
683059078210490
daje lepsze rezultaty niż można by się spodziewać.
Git ma jeszcze możliwość opcji --patience, która poprawia, jednak
wyszukując unikalne wiersze - nie nadaje się np. do genomu.
Następne wpisy z tego wątku
- 05.02.18 18:13 M.M.
- 05.02.18 22:19 Borneq
- 06.02.18 10:55 M.M.
- 09.02.18 11:09 Borneq
- 09.02.18 12:42 Borneq
Najnowsze wątki z tej grupy
- Can you activate BMW 48V 10Ah Li-Ion battery, connecting to CAN-USB laptop interface ?
- We Wrocławiu ruszyła Odra 5, pierwszy w Polsce komputer kwantowy z nadprzewodzącymi kubitami
- Ada-Europe - AEiC 2025 early registration deadline imminent
- John Carmack twierdzi, że gdyby gry były optymalizowane, to wystarczyły by stare kompy
- Ada-Europe Int.Conf. Reliable Software Technologies, AEiC 2025
- Linuks od wer. 6.15 przestanie wspierać procesory 486 i będzie wymagać min. Pentium
- ,,Polski przemysł jest w stanie agonalnym" - podkreślił dobitnie, wskazując na brak zamówień.
- Rewolucja w debugowaniu!!! SI analizuje zrzuty pamięci systemu M$ Windows!!!
- Brednie w wiki - hasło Dehomag
- Perfidne ataki krakerów z KRLD na skrypciarzy JS i Pajton
- Instytut IDEAS może zacząć działać: "Ma to być unikalny w europejskiej skali ośrodek badań nad sztuczną inteligencją."
- Instytut IDEAS może zacząć działać: "Ma to być unikalny w europejskiej skali ośrodek badań nad sztuczną inteligencją."
- Instytut IDEAS może zacząć działać: "Ma to być unikalny w europejskiej skali ośrodek badań nad sztuczną inteligencją."
- U nas propagują modę na SI, a w Chinach naukowcy SI po kolei umierają w wieku 40-50lat
- C++. Podróż Po Języku - komentarz
Najnowsze wątki
- 2025-07-17 Warszawa => Senior IT Recruitment Consultant <=
- 2025-07-17 Warszawa => IT Hardware Specialist - Wsparcie i Konfiguracja <=
- 2025-07-17 Warszawa => Przedstawiciel handlowy / KAM (branża TSL) <=
- 2025-07-16 deltaT w pompie ciepla
- 2025-07-16 dron na granicy polsko niemieckiej
- 2025-07-16 Warszawa => Senior IT Recruitment Consultant <=
- 2025-07-16 Gdańsk => Mainframe (z/OS, Assembler) Developer <=
- 2025-07-16 Gdańsk => Delphi Programmer <=
- 2025-07-16 Warszawa => BI Developer <=
- 2025-07-16 Gdańsk => Programista Delphi <=
- 2025-07-16 chroń PESEL dziecka
- 2025-07-16 Rzeszów => Spedytor Międzynarodowy <=
- 2025-07-16 Gdańsk => Konsultant wdrożeniowy (systemy controlingowe) <=
- 2025-07-16 Kraków => Kotlin Developer <=
- 2025-07-16 Warszawa => Inżynier oprogramowania .Net <=