-
Data: 2018-02-05 13:53:07
Temat: Re: Ktoś używał 1000genomes? Diff
Od: Borneq <b...@a...hidden.pl> szukaj wiadomości tego autora
[ pokaż wszystkie nagłówki ]W dniu 05.02.2018 o 10:31, M.M. pisze:
> Dziedzina wiedzy dziedziną wiedzy, ale porównania się robi i używa się
> do tego analogicznych algorytmów jak do porównywania ciągów znaków.
Czytałem o algorytmie Myersa wspaniale wytłumaczonym na blogu jcoglan.
Znajduje maksymalny wspólny podciąg, ale rozwiązań może być wiele. W
podstawowej wersji ma tę miłą właściwość że gromadzi inserty i delety
razem. Jednak wersja profesjonalna, używająca liniowego a nie
kwadratowego miejsca pamięci, nie ma tej właściwości.
Przykład:
https://blog.jcoglan.com/2017/03/22/myers-diff-in-li
near-space-theory/
Jak można by to poprawić? Może najpierw rekurencyjnie dzielić na bloki,
ale gdy blok nie przekracza 50 wierszy, robić wersję standardową?
Poza tym, implementacja Butlera z CodeProject dla liniowego:
782104906830590
683059078210490
daje lepsze rezultaty niż można by się spodziewać.
Git ma jeszcze możliwość opcji --patience, która poprawia, jednak
wyszukując unikalne wiersze - nie nadaje się np. do genomu.
Następne wpisy z tego wątku
- 05.02.18 18:13 M.M.
- 05.02.18 22:19 Borneq
- 06.02.18 10:55 M.M.
- 09.02.18 11:09 Borneq
- 09.02.18 12:42 Borneq
Najnowsze wątki z tej grupy
- A Szwajcarzy kombinują tak: FinalSpark grows human neurons from stem cells and connects them to electrode arrays
- Re: Najgorszy język programowania
- NOWY: 2025-09-29 Alg., Strukt. Danych i Tech. Prog. - komentarz.pdf
- Na grupie comp.os.linux.advocacy CrudeSausage twierdzi, że Micro$lop używa SI do szyfrowania formatu dok. XML
- Błąd w Sofcie Powodem Wymiany 3 Duńskich Fregat Typu Iver Huitfeldt
- Grok zaczął nadużywać wulgaryzmów i wprost obrażać niektóre znane osoby
- Can you activate BMW 48V 10Ah Li-Ion battery, connecting to CAN-USB laptop interface ?
- We Wrocławiu ruszyła Odra 5, pierwszy w Polsce komputer kwantowy z nadprzewodzącymi kubitami
- Ada-Europe - AEiC 2025 early registration deadline imminent
- John Carmack twierdzi, że gdyby gry były optymalizowane, to wystarczyły by stare kompy
- Ada-Europe Int.Conf. Reliable Software Technologies, AEiC 2025
- Linuks od wer. 6.15 przestanie wspierać procesory 486 i będzie wymagać min. Pentium
- ,,Polski przemysł jest w stanie agonalnym" - podkreślił dobitnie, wskazując na brak zamówień.
- Rewolucja w debugowaniu!!! SI analizuje zrzuty pamięci systemu M$ Windows!!!
- Brednie w wiki - hasło Dehomag
Najnowsze wątki
- 2025-12-27 pompa CO
- 2025-12-27 Gdynia => Przedstawiciel handlowy / KAM (branża TSL) <=
- 2025-12-27 Ewakuacja ludności
- 2025-12-26 Gdańsk => ERP Microsoft Dynamics 365 Commerce Consultant <=
- 2025-12-26 Kraków => Konsultant Microsoft Dynamics 365 Finance <=
- 2025-12-26 Kraków => Microsoft Dynamics 365 Finance Consultant <=
- 2025-12-26 wymieniłem termostat
- 2025-12-26 Warszawa => Senior Backend Java Developer <=
- 2025-12-25 Finlandia przywraca swastykę
- 2025-12-25 Skuteczność wymiaru sprawiedliwości
- 2025-12-24 Felgi
- 2025-12-24 2,5 x więcej niż Li-Ion
- 2025-12-24 No i kolejny ograniczony
- 2025-12-24 Warszawa => Młodszy Specjalista ds. wsparcia sprzedaży <=
- 2025-12-24 New York Times zagrożeniem bezpieczeństwa narodowego USA - POTUS D. Trump




5 Najlepszych Programów do Księgowości w Chmurze - Ranking i Porównanie [2025]