[...]
> Datasheet nie
> precyzuje jakie to mają być przewody prowadzące od tej złączki do styków
> termopary, ale skoro układ ma kompensację to rozumiem, że mogą to być
> przewody miedziane pod warunkiem, że układ będzie w tej samej temp. co
> styki termopary. Przewody mają 10cm i wszystko jest w temp. pokojowej.

Z opisu wynika, że wstawiłeś sobie w układ termopary pasożytnicze z miedzi.
Rozrysuj układ, gdzie, jaki materiał jest, w jakiej temperaturze.
Ogólnie pisząc, miedź nie jest materiałem na przewody przedłużające,
jeśli w takim charakterze występują one w układzie pomiarowym.
K.